theba
.....\3rdparty
.....\........\ij139f-src.zip
.....\........\Jama-1.0.2.tar.gz
.....\doc
.....\...\devdoc.zip
.....\Doxyfile
.....\src
.....\...\.classpath
.....\...\.project
.....\...\build.html
.....\...\ChangeLog.txt
.....\...\ij-138.jar
.....\...\Jama-1.0.2.jar
.....\...\LICENSE.html
.....\...\make.cmd
.....\...\Makefile
.....\...\META-INF
.....\...\........\MANIFEST.MF
.....\...\run.cmd
.....\...\theba
.....\...\.....\core
.....\...\.....\....\BackTrack.java
.....\...\.....\....\BoxBounds.java
.....\...\.....\....\Fiber.java
.....\...\.....\....\FiberSlice.java
.....\...\.....\....\FindRegionDialog.java
.....\...\.....\....\gui
.....\...\.....\....\...\Binary3DImage.java
.....\...\.....\....\...\ImagePane.java
.....\...\.....\....\...\OpenDialog.java
.....\...\.....\....\...\ThebaGUI.java
.....\...\.....\....\...\ThebaPrefs.java
.....\...\.....\....\ImageFunctions.java
.....\...\.....\....\io
.....\...\.....\....\..\DataConversion.java
.....\...\.....\....\..\HeapReader.java
.....\...\.....\....\..\SliceReader.java
.....\...\.....\....\..\SliceWriter.java
.....\...\.....\....\..\SliceWriterCached.java
.....\...\.....\....\..\VolumeReader.java
.....\...\.....\....\Lumen.java
.....\...\.....\....\LumenCandidate.java
.....\...\.....\....\math
.....\...\.....\....\....\ConvexAnalyzer.java
.....\...\.....\....\....\DistancePath.java
.....\...\.....\....\....\EDM.java
.....\...\.....\....\....\NonUniformInterpolation.java
.....\...\.....\....\....\Point3D.java
.....\...\.....\....\....\Vector3D.java
.....\...\.....\....\Plugin.java
.....\...\.....\....\PluginLoader.java
.....\...\.....\....\Region.java
.....\...\.....\....\RegionDescriptor.java
.....\...\.....\....\RegionMask.java
.....\...\.....\....\RegionMask2D.java
.....\...\.....\....\Seed.java
.....\...\.....\....\ShapeDescriptor.java
.....\...\.....\....\Stack.java
.....\...\.....\....\Tracker.java
.....\...\.....\descriptors
.....\...\.....\...........\AvgCurvature.java
.....\...\.....\...........\AvgYoungCurvature.java
.....\...\.....\...........\BendingEnergyDescriptor.java
.....\...\.....\...........\CircularityDescriptor.java
.....\...\.....\...........\ConvexityDescriptor.java
.....\...\.....\...........\EccentricityDescriptor.java
.....\...\.....\...........\FreeSurfaceDescriptor.java
.....\...\.....\...........\InternalRegionDescriptor.java
.....\...\.....\...........\OrientationDescriptor.java
.....\...\.....\...........\OrientationDescriptor3D.java
.....\...\.....\...........\SizeDescriptor.java
.....\...\.....\...........\SizeDescriptor2D.java
.....\...\.....\...........\SolidityDescriptor.java
.....\...\.....\...........\SurfaceDescriptor.java
.....\...\.....\...........\YoungBendingEnergy.java
.....\...\.....\plugins
.....\...\.....\.......\Dilate3DPlugin.java
.....\...\.....\.......\DilatePlugin.java
.....\...\.....\.......\DistanceMap2DPlugin.java
.....\...\.....\.......\DistanceMapPlugin.java
.....\...\.....\.......\Erode3DPlugin.java
.....\...\.....\.......\ErodePlugin.java
.....\...\.....\.......\Median3DPlugin.java
.....\...\.....\.......\WatershedPlugin.java
.....\...\.....\trackers
.....\...\.....\........\BackTracker.java
.....\...\.....\........\FiberTracker.java
.....\...\.....\........\FloodTracker3D.java
.....\...\.....\........\HHTracker.java
.....\...\TODO.txt
.....\...\watershed
.....\...\.........\LICENSE
.....\...\.........\WatershedFIFO.java
.....\...\.........\WatershedPixel.java
.....\...\.........\WatershedStructure.java
.....\...\.........\Watershed_Algorithm.java
.....\...\watershed.jar
.....\userdoc
.....\.......\abstract.tex